A estrutura da pelagem dos cães consiste, basicamente, em sobrepelo e subpelo. O sobrepelo mais denso e desordenado protege contra a sujidade e humidade, enquanto o subpelo está ligado à regulação da temperatura. As diferenças anatómicas resultam de uma especialização que podemos observar em relação às diferentes raças, seja pelo tipo de atividade para o qual foram selecionadas ou pelas condições do clima. Outra particularidade da pele dos cães é a escassez de glândulas sudoríparas, pelo que os cães não transpiram. As únicas zonas pelas quais eliminam calor são a boca e as almofadas plantares onde podem ser encontradas mais glândulas sudoríparas, servindo ainda o propósito da marcação de território.